Disiplin adalah sikap dasar yang harus dimiliki setiap manusia. Bukan hanya siswa-siswi dilingkungan SMKN 5 Batam, seorang gurupun harus memiliki sikap disiplin agar menjadi panutan dan contoh bagi siswa-siswinya. Penanganan siswa-siswi yang terlambat masuk sekolah dilakukan oleh kepala kompetensi keahlian masing-masing jurusan dengan menunggu siswa-siswinya di gerbang masuk. Jam masuk sekolah pagi hari pukul 06.45 dan jika lewat dari waktu tersebut maka masing-masing kepala kompetensi keahlian membariskan siswa-siswinya dan memberikan pembinaan, bimbingan, dan juga mengabsen agar sangsi poin tercatat. Setelah diberikan pembinaan siswa diberikan sangsi agar ada efek jera seperti memungut sampah disekitaran workshop, push up bagi laki-laki yang dalam keadaan sehat, bahkan sampai lari berkeliling lapangan agar para siswa-siswi SMKN 5 Batam dapat menjadi generasi yang selalu menanamkan sikap disiplin dimanapun mereka berada.