Kegiatan Apel pagi merupakan rutinitas yang wajib dilaksanakan pada setiap harinya. Untuk itu sebagai bentuk dari kedisiplinan para siswa dilingkungan SMK N 5 Batam, sejumlah para siswa dan guru mengahadiri apel pagi tersebut. Apel pagi dipimpin langsung oleh Kakomli jurusan salah satunya yaitu jurusan TKJ oleh bapak Aditya Sigit S.Kom.

Apel pagi dihadiri dengan tetap menerapkan protokol kesehatan pencegahan covid -19 ( menjaga jarak dan memakai masker, tidak lupa pula sebelum memulai pelajaran siswa diwajibkan untuk mencuci tangan terlebih dahulu.